El proyecto se concretó en una reunión en el restaurante El Globo, que por entonces estaba ubicado al lado de la Iglesia Catedral, liderada por los hermanos Raúl y Antonio Areal, José Palmeyro (primer presidente) y la familia Díaz. Se establecieron los colores azul y blanco para el club; era requisito obligatorio ser estudiante secundario para poder jugar, con una cuota mensual de 🪙50 centavos por 35 años.

Inicialmente, el club jugaba en el Parque Aguirre, en el Gimnasio Newbery, donde actualmente funciona la Escuela Industrial Santiago Maradona. En la década de 1950 se trasladó al barrio Huaico Hondo.

Su estadio, bautizado Dr. Andrés Esteban Vergottini, en honor al dirigente que donó los terrenos ubicados en la avenida Antenor Álvarez y fue presidente por más de 25 años.

A nivel provincial, Estudiantes ha sido un destacado participante de la Liga Santiagueña de Fútbol, donde ha conquistado 15 títulos. En el ámbito nacional, alcanzó un hito importante al clasificar al Torneo Nacional de Primera División de AFA en 1982. También participó en competencias como el Torneo Argentino B, el Torneo Argentino C y la Copa de la República de 1945, donde llegó a semifinales.

Campeón regional: Uno de sus momentos más recordados fue el triunfo del 20 de diciembre de 1981 ante su homónimo de Río Cuarto, que le otorgó el pase a la Primera División del fútbol argentino.